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- 分类:知识&开发->AI->工具
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- 版权:CC BY-SA 4.0
- 创建:2019-10-13
- 更新:2020-11-23
原文链接(持续更新):https://neucrack.com/p/116
这里使用 docker , 安装环境更加简单(只需要装 NVIDIA 驱动,不需要装cuda,当然也不用为cuda版本烦恼)稳定~
而且可以同时运行多个 docker,比如同时运行多个 jupyterlab 给不同人使用
安装docker
安装 docker,版本必须是19.03及以上(可以使用docker --version
查看),如果版本低于这个版本,后面使用nvidia-docker
驱动就会失败,会提示找不到--gpu all
参数
安装
- 如果是Manjaro, 直接
yay -S docker
- 其他发行版:
参见官方教程:https://docs.docker.com/install/linux/docker-ce/debian/
deepin 是基于 debian 9.0
如果是 deepin 则需要修改sudo vim /usr/share/python-apt/templates/Deepin.info
里面的unstable为stable
并使用命令sudo add-apt-repository "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/debian stretch stable"
设置代理
如果下载慢,可能需要设置代理, 也可以不使用官方镜像,使用国内的镜像,比如 daocloud 镜像加速
docker 代理设置参考: https://neucrack.com/p/286
pull 镜像的时候可以设置代理让拉取更快, 创建容器时建议将代理去掉
设置当前用户可以访问docker(非root)
参考这里: https://docs.docker.com/install/linux/linux-postinstall/
sudo groupadd docker
sudo usermod -aG docker $USER
newgrp docker # 或者重新开启终端即可,如果未生效,可重启
常用命令
docker images
: 列出镜像列表docker run [options] image_name [command]
:从镜像新建一个容器docker ps
: 正在运行的容器docker ps -a
: 所有容器,包括没有正在运行的docker rm container_name
:删除容器docker rmi image_name
:删除镜像docker start container_name
:启动容器docker attatch container_name
:附着到容器里docker exec conrainer_name [comand]
:在容器中执行命令docker logs container_name
: 查看容器执行log
docker build -t image_name .
:从 Dockerfile 构建一个镜像
docker run 常用参数
-it
:启用交互式终端-rm
:及时删除,不保存容器,即退出后就删除--gpus all
:启用所有GPU支持-p port1:port2
:宿主机和容器端口映射,port1为宿主机的端口-v volume1:volume2
:宿主机和容器的磁盘映射, volume1是宿主机的文件夹,比如映射/home/${USER}/notes
到/tf/notes
--name name
:给容器取名,如果没有这个参数,名字就是随机生成的--device device:container_device
:挂在设备,比如/dev/ttyUSB0:/dev/ttyUSB0
--network=host
: 使用宿主机的网络--restart
: 自动启动, 可以用这个设置开机自启, 如果run的时候忘了可以用docker update --restart=always 容器名
来更新
no: 不自动重启容器. (默认value)
on-failure: 容器发生error而退出(容器退出状态不为0)重启容器
unless-stopped: 在容器已经stop掉或Docker stoped/restarted的时候才重启容器
always: 在容器已经stop掉或Docker stoped/restarted的时候才重启容器
安装显卡驱动
显卡安装部分独立写了一篇, 参考Linux Nvidia显卡安装
安装镜像
参考官方文档:https://www.tensorflow.org/install/docker
比如我这里Ubuntu:(一定看文档,可能会不一样,有更新)
按照 readme
中的installation guide
安装即可, 比如 Ubuntu
:
# Add the package repositories
distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | sudo apt-key add -
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.list | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/nvidia-docker.list
sudo apt-get update && sudo apt-get install -y nvidia-container-toolkit
sudo systemctl restart docker
如果是deepin,则需要改一下系统版本
distribution="ubuntu18.04"
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | sudo apt-key add -
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.list | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/nvidia-docker.list
sudo apt-get update && sudo apt-get install -y nvidia-container-toolkit
sudo systemctl restart docker
如果是 Manjaro, 只需要命令 yay -S nvidia-docker
即可!(如果遇到下载慢,可以使用poipo设置全局代理,参考终端代理设置方法)
- 测试 nvidia-docker 以及cuda能不能使用起来
使用nvidia/cuda
这个镜像,这个镜像只是用来测试,用完也可以删掉,如果没有设置代理,不想花费太多时间拉取镜像,可以不用这个镜像,直接使用tensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3
这个镜像或者neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
(或 daocloud.io/neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
)这个镜像(推荐)(在前者的基础上装了jupyterlab, 而且做了更好的用户权限管理)
lspci | grep -i nvidia
docker run --gpus all --rm nvidia/cuda nvidia-smi
比如:
➜ ~ sudo docker run --gpus all --rm nvidia/cuda nvidia-smi
Tue Mar 10 15:57:12 2020
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 440.64 Driver Version: 440.64 CUDA Version: 10.2 |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU Name Persistence-M| Bus-Id Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan Temp Perf Pwr:Usage/Cap| Memory-Usage | GPU-Util Compute M. |
|===============================+======================+======================|
| 0 GeForce GTX 106... Off | 00000000:01:00.0 On | N/A |
| 33% 39C P0 27W / 120W | 310MiB / 6075MiB | 0% Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes: GPU Memory |
| GPU PID Type Process name Usage |
|=============================================================================|
+-----------------------------------------------------------------------------+
Wed Mar 11 02:04:26 2020
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 430.40 Driver Version: 430.40 CUDA Version: 10.1 |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU Name Persistence-M| Bus-Id Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan Temp Perf Pwr:Usage/Cap| Memory-Usage | GPU-Util Compute M. |
|===============================+======================+======================|
| 0 GeForce GTX 108... Off | 00000000:04:00.0 Off | N/A |
| 35% 41C P5 25W / 250W | 0MiB / 11178MiB | 0% Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
| 1 GeForce GTX 108... Off | 00000000:81:00.0 Off | N/A |
| 39% 36C P5 19W / 250W | 0MiB / 11178MiB | 2% Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes: GPU Memory |
| GPU PID Type Process name Usage |
|=============================================================================|
| No running processes found |
+-----------------------------------------------------------------------------+
如果驱动版本太低,这里就会提示需要更新驱动
同时注意到cuda版本是10.2,可能tensorflow只支持到10.1,如果是在宿主机上直接装tensorflow就会报错不支持,这里用docker的好处就体现了,不用理会,只需要保证驱动装好就可以了
deepin 出现了错误
docker: Error response from daemon: OCI runtime create failed: container_linux.go:349: starting container process caused "process_linux.go:449: container init caused \"process_linux.go:432: running prestart hook 0 caused \\\"error running hook: exit status 1, stdout: , stderr: nvidia-container-cli: ldcache error: open failed: /sbin/ldconfig.real: no such file or directory\\\\n\\\"\"": unknown.
参考这里的解决方法:https://github.com/NVIDIA/nvidia-docker/issues/614 ,解决:
ln -s /sbin/ldconfig /sbin/ldconfig.real
docker 出现错误:nvidia-container-cli: initialization error: cuda error: unknown error
重启系统得到解决
运行 tensorflow with GPU
拉取镜像,直接拉取
docker pull neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
# docker pull tensorflow/tensorflow:latest-gpu-py3-jupyter
# docker pull tensorflow/tensorflow
# docker pull tensorflow/tensorflow:latest-gpu
国内可以使用放在 daocloud 的镜像,速度会快一些:
docker pull daocloud.io/neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
执行测试语句:
docker run --gpus all -it --rm neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab python -c "import tensorflow as tf; print('-----version:{}, gpu:{}, 1+2={}'.format(tf.__version__, tf.test.is_gpu_available(), tf.add(1, 2).numpy()) );"
如果使用了daocloud,镜像名需要修改成
daocloud.io/neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
如果没问题,就会出现以下输出(会伴随一大堆调试信息,也可能有警告信息,可以仔细看一下):
-----version:2.1.0, gpu:True, 1+2=3
Jupyterlab
docker run --gpus all --name jupyterlab-gpu -it -p 8889:8889 -e USER_NAME=$USER -e USER_ID=`id -u $USER` -e GROUP_NAME=`id -gn $USER` -e GROUP_ID=`id -g $USER` -v /home/${USER}:/tf neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
如果使用了daocloud,镜像名需要修改成
daocloud.io/neucrack/tensorflow-gpu-py3-jupyterlab
然后就能用浏览器在http://127.0.0.1:8889/
地址使用 jupyterlab
了,而且目录对应了设置的/home/${USER}
目录
退出直接Ctrl+C
即可
这个容器创建后会一直存在于电脑里,可以使用docker ps -a
查看到,下次启动使用
docker start jupyterlab_gpu
也可以附着到容器:
docker attatch jupyterlab_gpu
停止容器:
docker stop jupyterlab_gpu
删除容器:
docker rm jupyterlab_gpu
修改 user 和 root 密码, 这样就可以使用 sudo
命令了
docker exec -it jupyterlab_gpu /bin/bash
passwd $USER
passwd root
如果需要每次都重新新建一个容器,用完就删除,只需要在run
命令后面添加一个-rm
参数即可
其它问题
- 运行程序时提示: ResourceExhaustedError: OOM when allocating tensor with shape[784,128]
使用nvidia-smi
查看内存使用情况
tensorflow会一次性申请(几乎)所有显存:
➜ ~ nvidia-smi
Fri Mar 20 09:18:48 2020
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 435.21 Driver Version: 435.21 CUDA Version: 10.1 |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU Name Persistence-M| Bus-Id Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan Temp Perf Pwr:Usage/Cap| Memory-Usage | GPU-Util Compute M. |
|===============================+======================+======================|
| 0 GeForce GTX 108... Off | 00000000:04:00.0 On | N/A |
| 0% 48C P2 60W / 250W | 10726MiB / 11178MiB | 0% Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
| 1 GeForce GTX 108... Off | 00000000:81:00.0 Off | N/A |
| 0% 47C P2 58W / 250W | 197MiB / 11178MiB | 0% Default |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes: GPU Memory |
| GPU PID Type Process name Usage |
|=============================================================================|
| 0 3099 G /usr/lib/xorg/Xorg 21MiB |
| 0 40037 C /usr/bin/python3 10693MiB |
| 1 40037 C /usr/bin/python3 185MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+
有可能是使用显存的进程太多了,可以适当退出一些进程;
也有可能申请内存重复了 ,可以尝试重启容器解决
- 一直运行没有结果
重启docker 容器解决,总之遇事不决,重启解决。。
- 提示
could not retrieve CUDA device count: CUDA_ERROR_NOT_INITIALIZED
可能使用了多进程, 新的进程直接拷贝了当前进程的环境,导致错误, 解决办法是父进程需要引入, 在子进程中需要使用的时候单独import,而不是写到全局, 参考这里: https://abcdabcd987.com/python-multiprocessing/
ImportError: libGL.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory
apt install libgl1-mesa-glx
Failed to get convolution algorithm. This is probably because cuDNN failed to initialize
显卡内存不足,检查是不是被其它程序占用了,如果多张显卡,可以设置环境变量CUDA_VISIBLE_DEVICES
来设置将要使用的显卡, 比如这里共有三张显卡, 下标分别是0
,1
,2
, 选择第三张卡则设置为2
import os
os.environ["CUDA_VISIBLE_DEVICES"] = '2'