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  • 版权：CC BY-SA 4.0
  • 创建：2024-03-01
  • 更新：2024-03-01
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原文链接(持续更新）：https://neucrack.com/p/531

.fasta 转 structure / .xmfa 转 structure .str

代码： https://github.com/xavierdidelot/ClonalFrame/blob/main/xmfa2struct/xmfa2struct.c

  1. g++ xmfa2struct.c -o xmfa2struct
  2. sudo cp xmfa2struct /usr/bin
  1. xmfa2struct mttest.genome.fas mttest.genome.str

依照 纯序列的群体结构分析—STRUCTURE (windows版)会发现 fasta 和 xmfa 长得很像：
format_cvt

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